domingo, 26 de agosto de 2007

Escherichia Coli ( o para los amigos E. Coli )



Como estudiante de la carrera de Farmacia estoy acostumbrada a nombres raros y pensar en células, moléculas, virus y bacterias. Constantemente estamos pensando en cosas que sin un microscopio no podemos ver porque como dijo El Principito ( o si les gusta más Saint Exupery en su libro El Principito) ¨LO ESENCIAL ES INVISIBLE A LOS OJO¨. Y es una experiencia maravillosa cada día pararme delante de un microscopio y ver células, bacterias, etc porque tengo la posibilidad de día a día redescubrir a Dios en los invisible y poder maravillarme con cada diseño tan bien pensado por El.
Entonces, no es raro que los estudiantes y profesores de esta carrera tengan sus células favoritas, bacterias favoritas y demas. Por eso hoy les quiero presentar a mi bacteria favorita que es Eschericha Coli y su imagen es la primera. Prometo hablarles sobre mi célula favorita en otro momento. Ahora ustedes diran ¡¡¡¡¿¿¿ Qué tiene que ver la bacteria con la foto de ese perro???!!!! Ese perro es MI PERRO y se llama Coli, si E Coli un poco porque en casa todos lo llamamos asi y el responde a ese nombre y un poco en honor a las E coli, que aunque no lo crean estan muy cerca nuestro.

Cuando salte la cerca y crucé a Bolivia


Para lo que dicen que Bolivia no es un lugar hermoso, esta es una de las fotos de mis vacaciones. Estabamos con Jake viajando desde San Salvador de Jujuy ( Argentina) hasta Tupiza ( Bolivia). Este es uno de los preciosos paisajes de Bolivia.
Pronto más Fotos.

miércoles, 6 de junio de 2007

Watson consiguió el mapa de su propio genoma

JAMES WATSON ES UNO DE LOS DESCUBRIDORES DE LA ESTRUCTURA DEL ADN

El Premio Nobel de Medicina es la primera persona del mundo en tener su mapa genético.
Sabía que podía tener un ataque de ansiedad cuando lo viera. Pero si no duermo por las noches es pensando en la guerra de Irak más que en mi genoma", comentó risueño el científico norteamericano James Watson al recibir la secuencia completa de su genoma durante una ceremonia celebrada en Houston, Texas. A los 79 años, el premio Nobel de Medicina, descubridor de la estructura del ADN junto con Francis Crick en 1953, se convirtió en la primera persona en el mundo que obtiene su mapa genético.El estudio consiste en un análisis de su ADN que sirve para revelar qué tipos de enfermedades tiende a contraer cada persona. "El mapa genético es el primer paso para hacer de las secuencias individuales del genoma humano un proceso rápido, accesible y parte de la atención médica de rutina", según destacaron los investigadores que trabajaron durante dos meses sobre una muestra de sangre de Watson.Reconstruir su mapa tuvo un costo de un millón de dólares y surgió de la colaboración entre 454 Life Sciences Corporation, empresa privada especialista en secuenciar el ADN, y el Baylor College of Medicine. Es el último paso del ambicioso Proyecto Genoma Humano, lanzado en 1990 por el propio Watson. Considerado un hito en la historia de la ciencia, el programa buscó identificar los 20.000 a 25.000 genes del ADN humano. Tras 13 años de trabajo y unos 3.000 millones de dólares invertidos, se logró.El estudio reveló que Watson tiene algunas variaciones que pueden inducir al cáncer. El propio paciente reconoció haber padecido cáncer de piel y que su hermana sufrió cáncer de mama. El científico anunció que compartirá su genoma con aquellos investigadores que quieran conocerlo. Aunque aclaró que no divulgará la región que codifica la apolipoproteína E, la que muestra la predisposición de una persona hacia el mal del Alzheimer. Watson prefiere ignorar ese dato."Esta iniciativa ayudará a la gente. Por eso hace dos años acepté la propuesta. Espero que otras personas se animen y presten su código genético a la ciencia", comentó Watson. Según adelantaron los investigadores, no existen planes de elaborar nuevos mapas, aunque ellos quieren hacerlo en el futuro.Otro científico destacado de la genética, J. Craig Venter, anunció que depositó la semana pasada su código genético completo en GenBank, la base de datos que tienen los institutos nacionales de salud de Estados Unidos.HOUSTON, EE.UU. AP

martes, 22 de mayo de 2007

Estructura Molecular de los Acidos Nucleicos

Trabajo original de Watson y Crick

Una estructura para el Ácido Desoxirribonucleico
Deseamos sugerir una estructura para la sal del Ácido Desoxirribonucleico (A.D.N.). Esta estructura tiene aspectos novedosos que son de un interés biológico considerable.
Una estructura para el ácido nucleico ya ha sido propuesta por Pauling y Corey(1). Amablemente han puesto el manuscrito a nuestra disposición antes de su publicación. Su modelo consiste en tres cadenas entrelazadas, con los fosfatos cerca del eje de la fibra, y las bases hacia fuera. En nuestra opinión, esta estructura es poco satisfactoria por dos razones: (1) creemos que el material del que se obtienen los diagramas de rayos-X es la sal, no el ácido libre. Sin los átomos de hidrógeno del ácido no está claro qué las fuerzas puedan mantener la estructura unida, especialmente porque los fosfatos cargados negativamente cerca del eje se repelerían el uno al otro. (2) Algunas de las distancias de van der Waals parecen ser demasiado pequeñas.
Otra estructura en cadena triple ha sido sugerida por Fraser (en prensa). En su modelo los fosfatos, están hacia fuera y las bases hacia dentro, manteniéndose unidas por enlaces de hidrógeno. Esta estructura así descrita está más bien mal definida por lo que no la comentamos.
Deseamos ofrecer aquí una estructura radicalmente distinta para la sal del ácido desoxirribonucleico. Esta estructura tiene dos cadenas helicoidales cada vuelta en torno al mismo eje (ver diagrama). Hemos hecho las suposiciones químicas usuales, más específicamente, que cada cadena consiste en grupos fosfato-diéster uniendo residuos de ß-D-desoxirribofuranosa con enlaces 3',5'. Las dos cadenas (pero no sus bases) se relacionan por una díada perpendicular al eje de la fibra. Ambas cadenas siguen una hélice dextrógira, pero debido a las díadas las secuencias de átomos en las dos cadenas corren en direcciones opuestas. Cada una de las cadenas, por separado se parece al modelo Nº 1 de Furberg (2); esto es, las bases están sobre la parte interna de la espira y los fosfatos en la externa. La configuración del azúcar y los átomos cercanos se aproxima a la "configuración estándar" de Furberg, el azúcar se dispone perfectamente perpendicular a la base adjunta. Hay un residuo sobre cada cadena cada 3,4 Å en la dirección-z. Hemos asumido un ángulo de 36 grados entre residuos adyacentes en la misma cadena, para que la estructura se repita después de 10 residuos sobre cada cadena, esto es, después de 34 Å. La distancia de un átomo de fósforo desde el eje de la fibra es 10 Å. Como los fosfatos están sobre la parte externa, los cationes tienen fácil acceso a ellos. La estructura es abierta, y su contenido de agua es más bien alto. Para nosotros, a contenidos bajos las bases se acercarían y la estructura sería más compacta.
El aspecto novedoso de la estructura es la manera en que las dos cadenas se mantienen unidas por bases púricas y pirimidínicas. Los planos de las bases son perpendiculares al eje de la fibra. Se reúnen en pares, una base de una de las cadenas unida mediante enlaces de hidrógeno a una base de la otra cadena, y así las dos se unen lado a lado con idéntica coordenada z. Una del par debe ser purínica y la otra pirimidínica. Los enlaces de hidrógeno se hacen como se indica a continuación: purina en posición 1 con pirimidina en posición 1; purina en posición 6 con pirimidina en posición 6 [etc.]
Esta figura es puramente esquemática. Las dos cintas simbolizan las cadenas azúcar-fosfato, y las varillas horizontales los pares de bases que sostienen las cadenas unidas. La línea vertical marca el eje de la fibra.

Si se asume que las bases sólo aparecen dentro de la estructura en la forma tautomérica más plausible (que es, con la configuración ceto más que con la enol) se encuentran los pares específicos de bases que pueden unirse. Estos pares son: la adenina (purínica) con timina (pirimidínica), y guanina (purínica) con citosina (pirimidínica).
En otras palabras, si una adenina es uno de los miembros de un par, sobre una cadena, entonces el otro miembro debe ser timina; algo similar ocurre para la guanina y la citosina. La sucesión de bases sobre una cadena única no parece estar restringida de ninguna forma. Sin embargo, si sólo pueden formarse determinados pares de bases, se sigue que conociendo la sucesión de bases sobre una de las cadenas, entonces la sucesión sobre la otra cadena queda determinada automáticamente.
Se ha encontrado experimentalmente (3,4) que la relación de adenina a timina, y la relación de guanina a citosina, están siempre muy cerca de la unidad para el ácido desoxirribonucleico. Probablemente es imposible construir esta estructura con un azúcar ribosa en lugar de desoxirribosa, el átomo extra de oxígeno la haría demasiado cerrada y formaría un enlace de van der Waals.
Los datos de rayos-X anteriormente publicados (5,6) sobre el ácido desoxirribonucleico son insuficientes para una prueba rigurosa de nuestra estructura. Hasta el momento lo que podemos decir es a grosso modo compatible con los datos experimentales, pero debe observarse como improbado hasta que se haya verificado con resultados más exactos. Algunos de estos se aportarán en las siguientes comunicaciones. Nosotros no éramos conscientes de los detalles de los resultados presentados cuando ideamos nuestra estructura, que descansa principal aunque no enteramente sobre datos experimentales ya publicados y argumentos estereoquímicos.
No se escapa a nuestra comunicación que el emparejamiento específico que hemos postulado sugiere inmediatamente un mecanismo copiador para el material genético.
Todos los detalles de la estructura, incluyendo las condiciones presumidas para su construcción, junto con un conjunto de coordenadas para los átomos, se publicarán con posterioridad.
Estamos en deuda con el Dr. Jerry Donohue por las constantes críticas y consejos, especialmente sobre distancias interatómicas. También hemos sido estimulados por el conocimiento general de la naturaleza y los resultados experimentales inéditos así como ideas del Dr. M.H.F. Wilkins, la Dra. R.E. Franklin y sus colaboradores del King's College, en Londres. Uno de nosotros (J.D.W.) ha sido subvencionado por una beca de la Fundación Nacional para la Parálisis Infantil.
J.D. WATSON
F.H.C. CRICK
Medical Research Council Unit for the Study of the Molecular Structure Biological Systems
Cavendish Laboratory, Cambridge
2 de Abril

(1) Pauling, L. y Corey, R.B., Nature, 171, 346(1953); Proc.U.S.Nat.Sci., 39, 84(1953).
(2) Furberg, S. Acta Chem.Scand., 6, 634 (1952).
(3) Chargaff, e. Para la referencia ver Zamenhof, S., Brawerman, G. y Chargaff, E., Biochem. et. Biophys. Acta, 9, 402 (1952).
(4) Wyatt, G.R., J. Gen.Physiol., 36, 201 (1952).
(5) Astbury, W.T., Symp.Soc.Exp.Biol. 1, Nucleic Acid, 66 (Cambridge University Press, 1947).
(6) Wilkins, M.H.F. y Randall, J.T., Biochim. et Biophys. Acta, 10, 192 (1953).

Artículo publicado en la revista Nature, Abril 25, 1953, p. 737.